虽然是根据《游戏王DM》所改编，但万宝版也并非彻底照搬原作，在设定及剧情上做了许多改变。
设定改动之前说过。
由于DM里面的村规及“口胡印卡”现象泛滥，顾淼直接就弃用了原版规则，提前推出了后面才完善的决斗体系。
重点是剧情方面。
在主线剧情方面，顾淼并没有改变太多，但在一些支线以及细节方面，他还是做了查漏补缺。
海马与养父的故事，暗游戏与千年积木的来源，千年神器与法老王等等隐秘，都将在随后的剧集中，向观众们揭开神秘的面纱。
还有艾克佐迪亚……
在原版《游戏王DM》剧情中，游戏卡组里面的艾克佐迪亚，第一集刚露脸，第三集就“遗憾退场”了。
相信看到这里时，很多人都无法理解，为什么无冤无仇的前提下，羽蛾要扔掉游戏的艾克佐迪亚部件卡。
甚至还有人因此，对羽蛾这个角色产生了极大怨念。
其实这也不怪他。
为什么这么说呢？因为“羽蛾扔卡”这段剧情，压根就不是他本人的想法，而是动画制作组以及高桥和希的意思。
不扔卡，谁能赢游戏？
在早期《游戏王》的村规体系里，理论上一直用守备怪兽拖延，直到集齐部件卡，不需要任何战术就能躺赢。
艾克佐迪亚的强大，甚至比神之卡更加变态。
这简直就是无敌挂！
可能有人会吐槽了，说什么村规体系下，HP才2000点，艾克佐迪亚很容易卡手，招不到怪然后败北，哪来的无敌挂？
问这个问题的人，大概是忽略了一件事。
你用这套卡组会卡手，不代表王样会卡手啊！懂不懂什么叫主角光环，懂不懂仙术抽卡，懂不懂当场印卡的含金量啊？
口胡王会卡手？
这笑话，说出去也不怕把别人的假牙笑飞！
总而言之，原版《游戏王DM》里，艾克佐迪亚被毁事件，其实是制作组没办法处理这套卡。
所以就只能毁了。
不过那是原版，而且是村规体系下的艾克佐迪亚。到了万宝版，规则体系换了一套之后，艾克佐迪亚并非无敌。
也就没必要让羽蛾充当恶人，来出面替制作组，替高桥和希背黑锅了。
完全可以换个方式嘛！
比如禁止使用……
在决斗王国的比赛中，贝卡斯将率先提出“禁制卡”概念，先把艾克佐迪亚关进去不就行了？
禁止卡，限制卡。
这其实是一个蛮新鲜的概念，因为一张卡强到需要禁止、限制其使用，在早期的《游戏王》里压根就找不出几张。
艾克佐迪亚有资格提名。
因为早期都是“凡骨”怪兽为主，大家都是白板怪，魔法卡与陷阱卡花样还少的前提下，艾克佐迪亚确实很“超模”。
可以先关进去，等过段时间，效果怪兽成为主流。
魔法卡与陷阱卡花样频出之际，艾克佐迪亚已经没那么无解时，再放出来给游戏“偶尔神抽”几手也不错。
除此之外……
万宝版《游戏王》动画里，剧情出现的另一个关键转折点，便是“三幻神”，即神之卡了。
原版的神之卡只有三张，分别是内奸龙、祭品兵与诈尸鸟，这也是广大玩家最熟悉的三张“一代”神之卡。
而万宝版有六张神卡！
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